El Doctorado Interinstitucional en Derechos Humanos es un programa educativo con una organización semiflexible y una duración de 6 semestres en la modalidad escolarizada. El título que otorga es Doctor o Doctora en Derechos Humanos.

El número de créditos es de 150, calculados con los criterios del Sistema de Asignación y Transferencia de Créditos Académicos SATCA, con un total de 6 unidades de aprendizaje que integran el Campo Formativo de Investigación. Cada ciclo escolar está compuesto por 20 semanas. Del total de 6 unidades de aprendizaje que conforman el plan curricular, todas son obligatorias. El campo formativo de Investigación está conformado por unidades de aprendizaje que, en el seno de un Comité Doctoral nombrado ex profeso, orientan el trabajo de tesis de las y los doctorandos. Los contenidos son definidos por el Comité Doctoral, y se orientan al desarrollo de habilidades de búsqueda y manejo de información e investigación aplicada que, con una perspectiva de derechos humanos, problematicen el estado del arte, produzcan conocimiento original en la materia y les preparen para la comunicación idónea de sus avances y productos finales. Los contenidos teóricos y prácticos, por tanto, están incluidos en las unidades de aprendizaje en la modalidad de seminarios de investigación (I al VI) en los que se abordan las bases y fundamentos teóricos y de método que hacen posible el conocimiento, análisis exhaustivo, explicación y dominio teórico-práctico de los derechos humanos, lo que permite la identificación de temáticas, problemáticas y necesidades de intervención en la materia.